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2016年5月，美国发起“国家微生物组计划”，共计投入5.21亿美元，这是奥巴马政府继“精准医学计划”后提出的又一个大科学计划。一石激起千层浪，此举在全世界引发微生物组研究的热潮。在中国，科学家们正向国家大力呼吁中国微生物组计划研究，力争将其列入国家重点研发任务，5年应该要投入5-10个亿人民币左右的经费。
微生物组的主要原理与技术是宏基因组学。近几年，微生物宏基因组学研究在学术界受到重视，多篇论文发表在Nature, Cell, Nature Medicine, Nature Communications等国际一流学术期刊。在这方面，华大基因与中南大学做了很好的工作。例如，华大基因的肠道微生物与2型糖尿病方面的论文发表在Nature (2012)。微生物宏基因组学的原理与技术，特别是微生物16s宏基因组学, 已经运用到健康、污染防护、土壤与地质、食品安全、农业等各领域，为促进科学发展做出了卓越的贡献。
为普及微生物16s宏基因组学的原理与技术，促进科技进步，赢润生物集团联合中南大学、华大基因的一流专家，面向全国开展微生物16s宏基因组学培训。只要您有一台普通的办公电脑，通过我们的培训，您就能独立进行微生物16s宏基因组学的生物信息学分析，摆脱对生物信息分析师的依赖，论文发表如虎添翼。本培训适用于医学、农学、食品、环保、矿业、海洋等一切与微生物有关的专业。
快来报名参与学习吧！您也可以成为大数据分析与基因组学高手！
样品间OUT差异venn图
样品间物种差异柱状图
组间物种差异Heatmap
样品中物种系统进化树
分析筛选rag2与truc两组中微生物差异biomarkers图
一、培训时间
2016年7月22日-24日（共三天）
二、培训地点
湖南省赢通基因与细胞工程技术研究中心（长沙市岳麓区银盆南路317号4楼）
三、培训对象
从事医学、农学、食品、环保、矿业、海洋等与微生物相关领域的科研工作者、高校教师及研究生
四、培训方式
理论讲授和上机操作紧密结合。
五、课程安排
| 时间 | 内容 | |
|---|---|---|
| 7月22日 | 上午 | 理论 ① 高通量测序技术在微生物宏基因组学的应用； ② Linux基础命令； ③ Qiime进行OTU聚类分析与注释，R语言绘制Venn图； ④ 绘制各分类水平的柱形图、饼图、Heatmap图； ⑤ 统计分析组间各分类水平差异，确定组间差异OTU。 |
| 下午 | 上机 | |
| 7月23日 | 上午 | 理论 ① Qiime进行Alpha-多样性分析并比较组间Alpha-多样性差异； ② Qiime进行Beta-多样性分析并比较组间Beta-多样性差异； ③ FigTree构建各种系统树； ④ LefSe筛选组间差异Biomarker, 绘制Biomarker的进化分枝图与LDA柱形图。 |
| 下午 | 上机 | |
| 7月24日 | 上午 | 理论 ① usearch OTU聚类，RDP classifer进行OTU物种注释，包括细菌与真菌； ② 使用mothur进行alpha多样性分析； ③ 使用metastats进行组间差异分析； ④ 使用R语言画常见的柱形图、Heatmap图； ⑤ 功能基因宏基因组学概述。 |
| 下午 | 上机 | |
注意事项：为保证培训质量，请自带笔记本电脑（需8G或以上内存），安装windows 64位操作系统。
六、师资简介
朱飞舟：
2007年博士毕业于中南大学医学遗传学国家重点实验室，现任中南大学生命科学学院副教授，硕士生导师。全国素质教育模范教师，全国素质教育师德标兵，湖南省卫生经济与信息学会生物医学信息专业委员会委员。研究方向为医学基因检测与基因工程。承担国家、省、市级多个项目。国家发明专利2项。论文发表在 “Molecular Genetics, Microbiology and Virology”，Progress in Biochemistry and Biophysics, Chinese Science Bulletin, International Journal of Clinical and Experimental Medicine (submitted) 等。
陈建威：
华大基因生物信息分析工程师。熟悉Linux工作环境；熟悉perl语言编程，可撰写流程；对微生物、Meta、RNA、表观等产品及分析流程方法熟悉；论文发表在Front. Microbiol，Sci. Rep，Microb Ecol，Infect Dis Transl Med，PLoS ONE，J Biotechnol等。
特邀专家
Colin K. He：
教育背景：
○ 博士后, 生物化学, 宾夕法尼亚大学(常青藤), 费城, PA, 美国, Nov 2000年11月
○ 博士后, 物理化学, 明尼苏达大学, Minneapolis, MN, 美国, 1997年11月
○ 博士，物理化学，中国科学院化学研究所，北京，中国。1997年6月
○ 硕士，统计学, 特拉华 大学，Newark，DE, 美国. 2005年5月
○ 研究生学习，数据挖掘(人工智能)， 佐治亚大学，Athens, GA, 美国. 2002年12月
工作经历：
○ 组建StegoTech LLC., 宾州，美国，2016，预临床统及临床统计分析、医疗大数据挖掘；CSO。
○ Fulirebi, LLC. , 宾州，美国, 2011年 – 至今
工业: 机电仪器/医疗诊断 ；资深项目经理、高级统计师、质量控制专家
○ 美国东方医疗中心，纽约市，美国, 2012 – 至今
医疗健康，科技总监(CSO)
○ 中南大学湘雅医学院，2013 – 任期5年（2018）
教授(兼职)，生物统计、大数据挖掘
○ PerkinElmer(珀金埃尔默)公司，长岛，纽约，美国 , 2008年 – 2011年
工业: 光电仪器/健康诊断 ； 高级统计师、质量控制专家
○ Pfizer(辉瑞)公司，Groton, 康州，美国, 2007年 – 2008年
工业: 制药；数据挖掘/统计分析师
○ CareScience公司，费城, 宾州，美国 , 2006年 – 2007年
工业: 信息/医疗健康；大数据挖掘/统计分析顾问
七、培训费用
4800 元。费用包括：培训资料、教学。
户 名：湖南省赢通基因与细胞工程技术研究中心
开户银行：中国工商银行长沙岳麓山支行
账 号：1901 0272 0920 1045 114
八、联系方式
报名联系人：吴双
咨询电话：400-666-9168 0731-84317068
QQ:1670829912
电子邮件：yrbio.com@gmail.com
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